Karbapenem Dirençli Acinetobacter baumannii Enfeksiyonlarının Moleküler Epidemiyolojisinin Çok Merkezli Araştırması

Karbapenem Dirençli Acinetobacter baumannii Enfeksiyonlarının Moleküler Epidemiyolojisinin Çok Merkezli Araştırması [Kafkas J Med Sci]

Kafkas J Med Sci. 2023; 13(2): 197-205 | DOI: 10.5505/kjms.2023.10692

Karbapenem Dirençli Acinetobacter baumannii Enfeksiyonlarının Moleküler Epidemiyolojisinin Çok Merkezli Araştırması

Ayşe Karacalı Tunç¹, Togrul Nagiyev², Tülay Kandemir³, Melda Meral Ocal⁴, Fatih Köksal⁵
¹Iğdır Üniversitesi, Diş Hekimliği Fakültesi, Temel Bilimler Abd, Tıbbi Mikrobiyoloji, Iğdır, Türkiye
²Çukurova Üniversitesi, Abdi Sütçü Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksek okulu, Tıbbi Mikrobiyoloji, Adana, Türkiye
³Çukurova Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji, Adana, Türkiye
⁴Mersin Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Tıbbi Mikrobiyoloji, Mersin, Türkiye
⁵Çukurova Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Adana, Türkiye

Amaç: Acinetobacter baumannii, antibiyotik direnci giderek artan ve tüm dünyada endişe yaratan önemli bir patojendir. Türkiye’nin yedi farklı merkezinden temin edilen çoklu ilaca dirençli A.baumannii izolatları arasındaki epidemiyolojik verileri ve moleküler farklılıkları sağlamayı amaçladık.
Materyal ve Metot: Yüz altmış altı çoklu ilaca dirençli A.baumannii suşu çalışmaya dâhil edildi. Tüm izolatlar EUCAST kriterlerine göre antibiyotik duyarlılığı açısından test edildi. Karbapenem dirençli A.baumannii izolatlarının moleküler olarak doğrulanması amacıyla polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi ile spesifik blaOXA-51 benzeri gen bölgesi saptanmıştır. Çoklu ilaca dirençli izolatlar arasındaki olası filogenetik ilişki, Pulsed-field jel elektroforez (PFGE) yöntemi kullanılarak araştırıldı.
Bulgular: 166 karbapenem dirençli A.baumannii suşu, CHEF-DRII elektroforez sistemi kullanılarak ApaI-PFGE yöntemi ile değerlendirildi. Toplam 51 küme 142 pulsotipte gruplandı. Yirmi kümenin tek üyeleri vardı. Otuz bir küme birden fazla üyeye sahipti ve A, B, … ve Z26 gibi alfabenin büyük harfleriyle tanımlanıyordu. Kırk PFGE profilinin %100 ilişkili olduğu görüldü.
Tartışma: Hasta sayısı fazla olan illerde daha yoğun bulaşma söz konusudur. Yedi farklı merkezden dördünde örnek sayısı, antibiyotik direnci ve klonal ilişki açısından diğer üç merkeze göre daha masum sonuçlar elde edildi. Ancak bunun nedeni nüfusun az olması ve sağlık hizmetlerinin yetersiz olması olabilir. Bölgesel ya da çok merkezli çalışmalar oldukça sınırlıdır. Bu nedenle daha fazla merkezi ve daha geniş popülasyonları içeren çalışmalara ihtiyaç vardır. Sonuç olarak bu çalışmanın sınır bölge olarak ileride yapılacak çalışmalara ışık tutacağı ve iyi bir literatür oluşturacağı kanaatindeyiz.

Anahtar Kelimeler: A.baumannii, blaOXA-51 benzeri gen, karbapenem dirençli, Pulsed-field jel elektroforez, PCR

Multicenter Research of the Molecular Epidemiology of Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii Infections

Ayşe Karacalı Tunç¹, Togrul Nagiyev², Tülay Kandemir³, Melda Meral Ocal⁴, Fatih Köksal⁵
¹1Medical Microbiology, Department of Basic Sciences, Igdir University Faculty of Dentistry, Igdir, Türkiye
²Medical Microbiology, Abdi Sutcu Vocational School of Health Services, Cukurova University, Adana, Türkiye
³Medical Microbiology, Cukurova University Faculty of Medicine, Adana, Türkiye
⁴Medical Microbiology, Department of Biotechnology, Mersin University Faculty of Science, Mersin, Türkiye
⁵Department of Medical Microbiology, Cukurova University Faculty of Medicine, Adana, Türkiye

Aim: Acinetobacter baumannii is an important pathogen causing concern worldwide with increasing antibiotic resistance. We aimed to provide epidemiological data and molecular differences between multidrug resistant A.baumannii isolates obtained from 7 different centers in Türkiye.
Material and Method: One hundred sixty-six multidrug-resistant A.baumannii strains were included in the study. All the isolates were tested for antibiotic susceptibility according to EUCAST criteria. To molecularly confirm the carbapenem-resistant A.baumannii isolates, the specific blaOXA-51-like gene region was detected by polymerase chain reaction (PCR) method. A possible phylogenetic relationship between multi-drug resistant isolates was investigated using Pulsed-field Gel Electrophoresis method.
Results: One hundred sixty-six carbapenem-resistant A.baumannii strains were evaluated by the ApaI-PFGE (Pulsed-field gel electrophoresis –PFGE) method using the CHEF-DRII electrophoresis system. A total of 51 clusters were grouped into 142 pulsotypes. Twenty clusters had single members. Thirty-one clusters had multiple members and were identified with the capital letters of the alphabet such as A, B, …, and Z26. It was observed that 40 PFGE profiles showed 100% related.
Conclusion: More intense contamination is in question in the provinces with many patients. In four of the seven different centers, more innocent results were obtained in terms of the number of samples, antibiotic resistance and clonal relationship when compared to the other three centers. However, this may be caused by the low population zone and inadequate health services. Regional or multicenter studies are minimal. Thus, further studies involving more centers and larger populations are needed. Consequently, the present study will shed light on future studies and create thriving literature on border regions.

Keywords: A.baumannii, blaOXA-51-like gene, carbapenem-resistant, pulsed-field gel electrophoresis; PCR

Ayşe Karacalı Tunç, Togrul Nagiyev, Tülay Kandemir, Melda Meral Ocal, Fatih Köksal. Multicenter Research of the Molecular Epidemiology of Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii Infections. Kafkas J Med Sci. 2023; 13(2): 197-205

Sorumlu Yazar: Ayşe Karacalı Tunç, Türkiye

ARAÇLAR