Sepsis Ön Tanısı Alan Hastaların Kan Kültürü ve Multiplex PCR Sonuçlarının KarşılaştırılmasıNurullah Çiftçi, Nima Hassan Waberi, Yasemin Dostuoğlu, Murat Karamese, Özgür ÇelebiKafkas Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Kars, Türkiye
Amaç: Sepsis, birçok sistemi tutan, özellikle hemodinamik değişikliklere yol açabilen, şok, organ fonksiyon bozukluğu ve yetmezliğine kadar gidebilen öldürücü bir enfeksiyondur. Kan kültürü altın standart yöntem olduğu halde bazı durumlarda etken izole edilememekte ve bu durum tanı ve tedavide ciddi zorluklara yol açarak mortalite ve morbidite oranlarına etki etmektedir. Bu çalışmanın amacı, rutin laboratuvarımıza gönderilen kan kültürü ve Multiplex PCR sepsis paneli sonuçlarının retrospektif ve prospektif olarak değerlendirilmesidir.
Materyal ve Metod: Bu çalışmada, 1 Eylül 2023 – 31 Ağustos 2024 tarihleri arasında laboratuvarımıza gönderilen kan kültürü ve sepsis panel istemi yapılan 100 örnek prospektif ve retrospektif olarak incelenmiştir. Kan kültür cihazında pozitif üreme sinyali veren tüm şişeler gram boyama yapılmış ve eş zamanlı olarak %5 koyun kanlı kanlı agar, EMB, SDA ve Çikolatamsı agar besiyerlerine ekimleri yapılmıştır. Tüm plaklar 37°C’de 24–48 saat inkübe edildikten sonra izole edilen suşlar konvansiyonel yöntemler (koloni morfolojisi, gram boyama vb.) ve biyokimyasal testler (katalaz testi, oksidaz testi, lam ve tüpte koagülaz) ile tanımlanmıştır. Sepsis paneli için örnekler laboratuvara geldiğinde örneklerin nükleik asit ekstraksiyonu, manyetik boncuk yöntemine dayanan toplam nükleik asit ekstraksiyon kiti kullanılarak, üretici firmanın talimatları doğrultusunda gerçekleştirilmiştir.
Bulgular: Çalışmaya dâhil edilen 100 sepsisli hasta örneğinin PCR sonuçlarına göre dört örnekte Candida türleri saptanmıştır. Aynı örneklerden yapılan kan kültürlerinde de Candida türleri saptanmıştır. Suşların dağılımı sepsis panelinde C.tropicalis, C.albicans, C.glabrata ve C.krusei olarak tespit edilmiştir. Kan kültür sonucunda üç örnek sepsis paneli ile aynı sonuçlanırken bir örnek sepsis sonucuna kıyasla konvansiyonel olarak C.glabrata olarak tanımlanmıştır. Bakteriyel etkenler arasında en sık sırasıyla Staphylococcus spp. (56), ikinci sıklıkta E.coli raporlanmıştır.
Sonuç: Çalışmanın sonucunda, PCR’nin sepsis tanısı koymada etkin bir yöntem olduğu, ancak bazı sonuçların kan kültürü ile doğrulanması gerektiği ortaya çıkmıştır. PCR testi ile elde edilen sonuçlar, özellikle hızlı ve doğru bilgi sağlanması gerektiği durumlarda (örneğin, yoğun bakım ve acil servisler gibi) faydalıdır. Ancak, testin ölü bakteri DNA’sını çoğaltma özelliği nedeniyle dikkatli bir şekilde yorumlanması gerektiği unutulmamalıdır. Klinik uygulamalarda her iki testin birlikte kullanılması, hastaların daha etkili bir şekilde tedavi edilmesini sağlayacaktır. Anahtar Kelimeler: sepsis, kan kültürü, multiplex PCR
Comparison of Blood Culture and Multiplex PCR Results in Patients Prediagnosed with SepsisNurullah Çiftçi, Nima Hassan Waberi, Yasemin Dostuoğlu, Murat Karamese, Özgür ÇelebiDepartment of Medical Microbiology, Kafkas University, Faculty of Medicine, Kars, Türkiye
Aim: Sepsis is a life-threatening infection that affects multiple systems, leading to hemodynamic changes, shock, organ dysfunction, and potentially organ failure. Although blood culture is the gold standard for identifying the causative agent, the pathogen cannot be isolated in some cases, posing significant challenges in diagnosis and treatment, affecting mortality and morbidity rates. The aim of this study is to retrospectively and prospectively evaluate the results of blood cultures and the Multiplex PCR sepsis panel sent to Microbiology laboratory.
Material and Method: In this study, 100 samples sent to our laboratory for blood culture and sepsis panel between September 1, 2023, and August 31, 2024, were analyzed retrospectively and prospectively. All bottles with a positive signal were subjected to Gram staining, and simultaneous inoculations were made on 5% sheep blood agar, EMB, SDA, and Chocolate agar. After 24–48 hours of incubation at 37°C, the isolated strains were identified using conventional methods (colony morphology, Gram staining, etc.) and biochemical tests (catalase test, oxidase test, tube and slide coagulase tests). For the sepsis panel, nucleic acid extraction was performed on samples received in the laboratory using a total nucleic acid extraction kit based on magnetic bead technology, following the manufacturer’s instructions.
Results: According to the PCR results of the 100 blood samples included in the study, Candida species were detected in 4 samples. Candida species were also identified in the blood culture. The distribution of strains in the sepsis panel included C.tropicalis, C.albicans, C.glabrata, and C.krusei. Among the blood culture samples, three demonstrated results that were consistent with the sepsis panel findings, while one sample was identified as C.glabrata through conventional methods, in contrast to the result from the sepsis panel. Among bacterial pathogens, Staphylococcus spp. was the most frequently identified (56 cases), followed by Escherichia coli.
Conclusion: The results of this study demonstrate that PCR is an effective method for diagnosing sepsis; however, some results need to be confirmed by blood culture. PCR testing provides rapid and accurate information, particularly in situations where quick results are essential, such as in intensive care units and emergency departments. However, it should be noted that PCR can amplify DNA from dead bacteria, so results should be interpreted with caution. In clinical practice, the combined use of both tests will contribute to more effective patient management and treatment. Keywords: sepsis, blood culture, multiplex PCR
Nurullah Çiftçi, Nima Hassan Waberi, Yasemin Dostuoğlu, Murat Karamese, Özgür Çelebi. Comparison of Blood Culture and Multiplex PCR Results in Patients Prediagnosed with Sepsis. Kafkas J Med Sci. 2025; 15(2): 184-189
Sorumlu Yazar: Nurullah Çiftçi, Türkiye |
|
Tam Metin PDF
Yazdır
Alıntıyı İndir
RIS
E-Postala
Paylaş
Yazara e-posta gönder
PubMed
